Конечно, лучше брать полностью готовый комплект. Во-первых, оптом всегда дешевле, а во-вторых, не нужно думать о том, где найти тот или иной материал. Заплатил - и через пару месяцев можно уже заселяться.
А попробуйте посчитать, сколько будет стоить дом в базовой комплектации + покупка дверей и окон самостоятельно + их монтаж И сколько будет стоить комплектация люкс с доставкой и монтажом дома. Так и узнаете ответ на свой вопрос.
Считаю, гораздо выгоднее и по деньгам, и по затраченному времени выбирать полный комплект. Если, как справедливо заметил Дмитрий, Вы не являетесь поставщиком строительных материалов или комплектующих.